據了解，目前已有眾多上市的豬圓環病毒疫苗，其中，全病毒滅活疫苗含PCV2所有蛋白；基因工程疫苗均表達Cap蛋白，僅僅載體不同，各有特點。無論哪種疫苗，最終在臨床使用中有效，才是好的疫苗。
豬圓環病毒疫苗免疫后的評估方法
很多養豬企業在評估疫苗功效方面面臨這樣的困惑：通過生產成績進行評估耗時長，且每次評估結論不一致。
目前評估豬圓環病毒疫苗的免疫效果，尚沒有國際公認的方法。按照國際慣例，可根據豬群健康狀況和生長成績的改善來進行評估，如減少臨床癥狀、降低死亡率、減少淘汰豬、改善日增重、改善均勻度、改善飼料轉化率、減少藥費開支等。
通過生產成績進行評估耗時長。參考發表文章，病毒血癥或排毒量（或用熒光定量PCR測定豬圓環病毒疫苗的核酸含量）可作為參考指標，但全程評估是最佳的。
2016年的研究表明，健康豬和PMWS豬之間的PCV2病毒載量存在統計學顯著差異
（p<0.01）。PMWS豬每毫升血清/血漿或每500ng組織中PCV2基因拷貝數106～107。如果在18～22周之間，檢測豬群的病毒血癥，用熒光定量PCR測定PCV2的核酸含量，若每毫升血清/血漿或每500ng組織中PCV2基因拷貝數超過106，則證明該疫苗未能很好地保護至18周或22周。這種方法僅作為參考，可能會被質疑不具有完整的科學意義。
也就是說建議結合起來考量，豬群健康狀況和生產成績的改善都很重要，另外病毒血癥或排毒量可以作為參考指標，全程評估是最佳的。
目前豬圓環病毒在全世界及我國感染普遍，不管是否免疫疫苗，豬群帶毒均較正常，通過抗原檢測，在健康的豬群也能檢測到豬圓環病毒，而疫苗免疫效果的評價之一，就是豬群病毒載量的下降。因此在疫苗免疫之后，對于抗原的檢測通過熒光定量PCR進行定量更好。
抗體檢測也是類似，也應該定量。未免疫豬群可在保育后期至育肥前期維持抗體陰性，但后期有感染率陽轉的過程，可以通過OD值來判斷豬群抗體水平的穩定性，并評價疫苗的免疫效果或者是本場生產管理及生物安全措施的執行情況。
總之，豬圓環病毒疫苗免疫后的評估方法：第一，臨床的評估，即豬圓環病毒�。≒CVD）的防控效果、生產指標的對比；第二，實驗室的評估，免疫抗體的應答、病毒血癥下降狀況的對比等。
目前公認的實驗室方法是，檢測免疫后病毒血癥的下降以及抗體水平的提高，來判斷疫苗免疫后的效果。當然，臨床指標的評判，包括疾病和生產指標，結合實驗室指標就更完整。
疫苗免疫后，豬群中仍然能夠檢測到豬圓環病毒，能說明疫苗保護不好嗎？
疫苗免疫后，仍然能夠檢測到豬圓環病毒，這要看使用的什么方法進行的檢測，如果使用熒光定量PCR方法檢測豬圓環病毒核酸含量超過106.0拷貝數，那要考慮疫苗沒有防控好，否則要多因素全面評估，如各項生產指標，日增重、料肉比、均勻度等。
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